Fasilitas kesehatan di Desa Cepoko sebanyak 1 Puskesmas Pembantu, 1 Tempat Praktek Dokter, 1 Tempat Praktik Bidan, 0 Pos Kesehatan Desa (Poskesdes), 1 Apotek, dan 0 Toko Khusus Obat/Jamu. Terdapat beberapa Upaya Kesehatan Bersumberdaya Masyarakat (UKBM) di Desa Cepoko. UKBM tersebut adalah posyandu, posbindu, serta adanya kader pelaksana KB/Kesehatan ibu dan anak. Jumlah posyandu aktif dan melakukan kegiatan atau pelayanan setiap sebulan di Desa Cepoko sebanyak posyandu unit. Selain itu, jumlah Posbindu atau Pos Pembinaan Terpadu di Desa Cepoko sebanyak posbindu unit.